Organizatori su rekli da su otkazali plivački dio triatlona koji je zakazan za nedjelju ujutro nakon sastanka o kvalitetu vode između nadležnih organa zaduženih za provođenje testova kvaliteta vode. To je uključivalo predstavnike Svjetskog triatlona, kao i gradske i regionalne vlasti.
Plivanje u Seni zabranjeno je više od jednog stoljeća, velikim dijelom zbog lošeg kvaliteta vode. Organizatori su uložili 1,5 milijardi dolara za pripremu Sene za ove Igre, a vlada je rekla da će rijeka biti dovoljno čista za održavanje događaja, uključujući plivački dio triatlona i maratonskog plivačkog događaja.
Dnevni testovi kvaliteta vode početkom juna pokazali su nesigurne nivoe bakterija E. coli, nakon čega su uslijedila poboljšanja.
Pariska gradonačelnica Anne Hidalgo se kupala u rijeci manje od dvije sedmice prije početka Olimpijskih igara, ispunivši obećanje da će pokazati da je voda čista za takmičenje.
Obilna kiša tokom ceremonije otvaranja dovela je do zabrinutosti oko toga da li će dugo zagađeni plovni put biti dovoljno čist za održavanje plivačkih takmičenja, budući da je kvalitet vode duboko povezan s vremenom u francuskoj prijestolnici.
Od 2015. godine organizatori su uložili velika sredstva kako bi pripremili Senu za Olimpijske igre i osigurali Parižanima čistiju rijeku nakon Igara. Plan je uključivao izgradnju ogromnog podzemnog bazena za skladištenje vode u centru Pariza, renoviranje kanalizacione infrastrukture i nadogradnju postrojenja za prečišćavanje otpadnih voda.
Triatlonci su izrazili nadu da će voda biti dovoljno čista da u njoj mogu plivati.